
Již při vstupu do baziliky nás zaujme jižní štít a vstupní portál. Štít zdobí čtyři erby, vysekané z vápence. Nejvýše je nekorunovaná orlice, pravděpodobně znak knížete Přemysla II. Velkopolského, pod ním vlevo korunovaný dvouocasý lev Království českého, uprostřed korunovaná orlice Království polského a vpravo erb s třemi kráčejícími korunovanými leopardy. Ten pravděpodobně odkazuje na švédského krále Valdemara I, dědečka Alžběty, který měl rovněž ve svém erbu kráčející leopardy. Význam těchto erbů i iniciála jejího jména Elisabeth, převýšenou královskou korunou, umístěnou pod římsou průčelí chtějí říci: „Tento chrám postavila Alžběta, královna česká a polská, ze švédského a polského královského rodu“.
Štít s erby a iniciálou zakladatelky

Dle návrhu Augusta Prokopa došlo koncem 19. století k přestavbě vstupního průčelí kostela. Místo původní římsy byla vybudována balustráda s chrliči a vznikl novogotický vstupní portál se stylovými vraty. Kamenické práce podle kresby Augusta Prokopa provedla firma Johanna Tomoly, dubová vrata vyrobil starobrněnský truhlář a kostelní hospodář Johann B. Rudisch. Ozdobné kování včetně šestatřiceti reliéfních železných desek výplní vrat zhotovil podle návrhu vídeňského architekta Fridricha Schmidta zámečník Carl Kerl z Jihlavy. Ideový návrh celého portálu navrhl farář Ambrož Poye.
Vstupní portál a vrata baziliky

Prostor mezi pravoúhlou římsou bankálu a tympanonem vyplnily nápisové pásky. Vlevo je verš žalmu 93 čtvrté Knihy žalmů DOMUM TUAM DOMINE DECET SANCTITUDO - „domu Tvému, Pane, přísluší svatost“, vpravo je verš 19.46 evangelia sv. Lukáše DOMUS MEA DOMUS ORATIONIS EST - „můj dům je domem modlitby“.
Oba verše tvoří ideovou jednotu se symbolikou Stvoření a Vykoupení na deskách vrat a sochařskou výzdobou tympanonu, symbolizující Posvěcení.
Stvoření je znázorněno na levém křídle vrat těmito deskami: A a Ω – počátek a konec, jako symbol pro Boha Otce jakožto Stvořitele, svět znázorněn sluncem, měsícem a hvězdy a čtyřmi živly, slon s nápisem TERRA představuje zemi, vodní nestvůra s nápisem AQUA vodu, pták s nápisem AER vzduch, a oheň chrlící drak s nápisem IGNIS oheň.
Pravé křídlo vrat představuje Vykoupení: deska se starým řeckým znamením XP pro naznačení jména Kristova, deska se slunečnicí znamená církev, je obrazem víry a modlitby, kterou se věřící obrací ke Kristu tak, jako se slunečnice otáčí za sluncem, další čtyři desky jsou zdobeny atributy evangelistů: sv. Matouše jako anděla v lidské podobě, jelikož své evangelium počíná rodokmenem Ježíše Krista, sv. Marka jako Iva, protože jeho evangelium počíná kázáním sv. Jana Křtitele na poušti, sv. Lukáš znázorněn býkem jako obětním zvířetem, jelikož jeho evangelium počíná obětí velekněze Zachariáše a sv. Jan je pak znázorněn orlem, jelikož u počátku svého evangelia se jako orel povznáší k Bohu.
Tyto symbolické figury se opakují každá na vratech třikrát, dle Poya je to odkaz na Nejsvětější Trojici.
Ikonografie portálu a vrat vrcholí Posvěcením, které představuje sousoší Korunování Panny Marie v tympanonu. Počínaje Bohem Otcem a stvořením světa podle Starého zákona, pokračujíc symbolikou Ježíše Krista a evangelistů z textů Nového zákona se dostáváme k dominantnímu sousoší Krista na trůnu, korunujícího Pannu Marii.
Zatímco doba vzniku kování vrat a reliéfů je uvedena na madlech vyraženými nápisy Carl Kerl Iglau 1888, rekonstrukce průčelí chrámu byla dokončena v roce 1889 umístěním sousoší Korunování Panny Marie do tympanonu portálu. Jedná se o polychromovanou dřevořezbu z borovice limby od akademického sochaře Aloise Winklera z Innsbrucku.
Pravděpodobně poslední akcí této rekonstrukce portálu bylo roku 1891 osazení dvou soch andělů brněnského sochaře Antona Dimy na nároží balustrády.
Výmalba
Původně byl kostel uvnitř bez omítky, z režného cihelného zdiva (malba byla nanášena přímo na cihly, což se ukázalo při rekonstrukci koncem 19. století, když byly odstraněny pozdější vrstvy vápenné omítky – DABB inv. č. 169 sg. 208 f.ú. Staré Brno). Po vydrancování a vypálení kostela byly stěny omítnuty a opakovaně bíleny vápnem, naposledy v roce 1874. Protože si farář Ambrož Poye při rekonstrukci kostela koncem 19. století přál barevné provedení výmalby, vypracoval architekt Richard Völkel návrh, dle kterého byl interiér v letech 1899 - 1902 vymalován bohatou ornamentální a figurální výzdobou.
Vlevo při vstupu do chrámu je umístěn latinský nápis se zprávou o rekonstrukci kostela na konci 19. století, která zní v českém znění:
„Pro slávu Spasitele a čest blahoslavené Marii Panně!
Obnova započata za opata Alselma Rambouska, který zemřel 25. ledna 1901, ukončena za vlády papeže Lea XIII., vladaře Rakousko-Uherska Františka Josefa I., diecésního biskupa brněnského Františka Saleského Bauera, za generálního převora augustiniánského řádu Thomase Rodrigueze, v konventu sv. Tomáše žijících Ern. Schwetz, Augustin Krátký, Karel Ondráček, Alois Slovák, Klement de Elpido Janetschek, František Saleský Bařina, Alphons de Orozeo Tkadlec, Cyril Seifert, Pavel Vlas, Tomáš Šilinger, Řehoř Jokl, Bernard Šústek, Antonín Burian, Jan Dvořáček a bratří Lukáše a Filipa. Namaloval Josef Kott“.
Nad vchodem je kopie votivního obrazu města Brna za pruského obležení roku 1742 podle originálního obrazu od Josefa Rottera, který je v klášterním muzeu. Tento obraz darovali brněnští měšťané Panně Marii Svatotomské (a tedy klášteru augustiniánů) na poděkování za ochranu Brna v době prusko-saského obležení. Latinský text po stranách fresky je v překladu tento:
„Kopie obrazu, který město Brno 7. dubna 1742 osvobozené z prusko-saského obklíčení prostřednictvím radních Brna jako znak vděčnosti na věčnou paměť věnuje blahoslavené Marii Panně osvoboditelce“. Originál obrazu od Josefa Rottera je v klášterním muzeu.
Kopie votivního obrazu nad vchodem do baziliky

Secesní výmalba klenby presbytáře

Ve slepých gotických oknech hlavní lodi i obou bočních příčných lodí jsou v kruhových medailoncích i na stěnách freskové obrazy světců a svatých přímluvců. Původně byly se zlatým popisem, žel, během doby část textů opadala.
Stropní klenba nad presbytářem
20 andělů oslavující Boha v nebi
Stropní klenba v křížení přední malé příčné lodi
4 evangelisté – sv. Matouš, sv. Marek, sv. Lukáš, sv. Jan
3 archandělé – Barachiel, Gabriel, Jehudiel
3 archandělé – Michael, Uriel, Rafael
Na pravé straně malé příčné lodi jsou augustiniánští světci a patroni:
P. Maria
sv. Augustin – mitra, berla, kniha
sv. Tomáš z Villanovy – pallium, biskupský kříž, žebrák,
sv. Jeroným (Hieronymus) – kříž, kniha
sv. Mikuláš Tolentinský – lilie, chleby, hvězda – symbol cností
sv. Jan z Fakunda (Sahagunský) – kalich s hostií
sv. Antoninus Martyr
sv. Monika
sv. Tecla – lev, lvice
sv. Maxima z Říma – mučednice, palmová ratolest
sv. Klára z Montefalka – srdce se stigmaty, lilie
sv. Rita z Cassie – stigma na čele
sv. Alphonsus (sv. Alfons de Orozco) – s křížem
sv. Antonín z Padovy – lílie, kniha, učitel církve
sv. Ambrož – pero, kniha, list – učitel církve
Na levé straně malé příčné lodi jsou postavy 14 svatých pomocníků:
sv. Dyonisius– useklá hlava, biskupská berla, mitra, pálium,
sv. Cyriacus – spoutaný démon, palma mučednictví,
sv. Acatius – setník římské armády, nabodáván na suchý akát,
sv. Eustachius – jelen s křížem mezi parohy,
sv. Jilji – opat – mitra, laň se šípem,
sv. Markéta antiochijská – koruna na hlavě, hůl s křížem, pokořený drak – ďábel,
sv. Kateřina Alexandrijská – kolo, meč, královská koruna,
sv. Barbora – kalich s hostií, koruna, palmová ratolest,
Sedmibolestná P. Maria
sv. Jiří – rytíř, praporec s křížem,
sv. Blažej – biskupská mitra a berla, dvě svíce k žehnání,
sv. Erasmus – střeva navinutá na hřídeli, biskupská mitra, berla,
sv. Pantaleon – sťat mečem, miska se lžící,
sv. Vít – kotel s ohněm,
sv. Kryštof – hůl, Ježíš na zádech
Fresky na stěnách v zadní části baziliky:
sv. Ludmila – s knížecí korunkou, šátkem kolem krku a palmou
sv. Alžběta Durinská – knížecí oděv a koruna, kytice růží
sv. Anežka – v řeholním rouchu, s korunou a lilií (blahoslavená 1874, svatořečená 1989)
sv. Cecílie – s varhanami
sv. Jan Sarkander – v kněžském rouchu, s křížkem - (blahořečen 1860, svatořečen 1995)
sv. Vojtěch – s mitrou a veslem
sv. Klement Maria Hofbauer – v kněžském rouchu, s knihou a křížkem
sv. Benedikt – řeholní plášť, číše
Fresky ve velké příčné lodi - naproti vchodu:
sv. Cyril a Metoděj a P. Maria – malý kůr
sv. Mikuláš Tolentinský – boční stěna u malého kůru, sloužící mši u oltáře
Vítězný oblouk v hlavní lodi u křížení s velkou příčnou lodí
Tři božské osoby s anděly
Alžběta Rejčka – pohled od kůru, zakladatelka, s kostelem v ruce
Sv. Ludmila na stěně baziliky

Ornamentální výzdobu chrámu provedenou pomocí šablon provedl dvorní dekorační malíř Josef Kott z Vídně.
Secesní výmalba časem vlivem vzdušné vlhkosti zpráškovatěla a byla silně znečištěna, od roku 1990 do roku 2002 byla proto výmalba postupně opravována.
Hlavní oltář
Nejviditelnějším barokním zásahem do gotického interiéru chrámu bylo v letech 1762—1765 pořízení jednotně pojatého vybavení kostela za poslední starobrněnské abatyše Antonie von Ulrici (1741—1782); k úplnému dokončení všech oltářů došlo roku 1769 díky přispění rodiny svobodného pána Jana Josefa von Lhuillier. Všemi návrhy a realizací architektury oltářů, jejich sochařské výzdoby a dalšího zařízení byla pověřena dílna významného brněnského sochaře Ondřeje Schweigla. Zakázku na hlavní oltář obdržela původně dílna jeho otce Antona Schweigela (1695-1761), po jeho smrti práce převzal jeho syn Ondřej.
Z šedého mramorového podstavce se zvedá zděná kulisa opatřená růžovým umělým mramorem. Sloupovou architekturu hlavního oltáře doplňují Schweiglovy rozměrné štukové sochy. U paty sloupů stojí sochy – vlevo sv. Benedikt s kalichem a sv. Alžběta Durinská s žezlem a košem, vpravo sv. Tekla se lvicí a křížkem v ruce a sv. Bernard z Clairvaux s nástroji Kristova umučení, sochy nad nikami – vlevo s monstrancí sv. Klára a vpravo sv. Luidgarda s křížem. V nástavci se nachází štukové sousoší Nejsvětější Trojice v oblacích s anděly, kteří se chystají korunovat Pannu Marii hvězdnými korunami. Velký oltářní obraz Nanebevzetí Panny Marie s dvanácti apoštoly namaloval před rokem 1763 brněnský malíř Josef Tadeáš Rotter dle předlohy Franze Antona Maulbertsche.
Presbytář baziliky se „stříbrným oltářem“ a obrazem Svatotomské Madony

Návrh a model hlavního oltáře, vyrobený pravděpodobně v dílně Antona Schweigela v roce 1760, je nyní ve Slezském zemském muzeu v Opavě, inv. č. U 1 B. Zajímavostí modelu je, že původně sloužil i jako domácí oltář, proto k němu byla dodatečně přidělaná i kopie obrazu Svatotomské madony. (E. W. Braun - Příspěvek k umělecké tvorbě Andrease Schweigela, 1931, Marek Pučalík - Maulbert Pinxit – zakázky Franze Antona Maulbertsche na Moravě a v Čechách, 2024)
Detail modelu oltáře z dílny Antona Schweigla ve Slezském muzeu s dodatečně přidělaným obrazem Svatotomské Madony

Na mramorový podstavec hlavního oltáře, který pochází z doby cisterciaček, byl augustiniány v roce 1783 umístěn stříbrný oltář se milostným obrazem Madony od sv. Tomáše.
Stříbrný oltář
Stříbrný oltář z let 1735—1736 s mariánskou ikonou italsko-byzantského typu z 12. - 13. století je bezpochyby nejvýznamnější pamětihodností kostela Nanebevzetí Panny Marie. Z mariánské kaple u sv. Tomáše se přinesli augustiniáni na Staré Brno tento tzv. „stříbrný oltář“ v roce 1783. Jedná se o mimořádné kovolitecké a zlatnické dílo z tepaného měděného plechu, zčásti zlaceného, převážně však překrytého plátkovým stříbrem. Některé části jsou lité. „Stříbrný oltář" zhotovil augsburský zlatník Johann Georg Herkommer v letech 1735-1736 při příležitosti korunovace obrazu Svatotomské Madony. Rozměrné dílo v ceně 33 tisíc zlatých bylo objednáno převorem Ondřejem Zirklem (1722—1736) v jihoněmeckém Augsburgu v souvislosti s plánovanou korunovací uctívaného obrazu Svatotomášské madony v květnu 1736, která představovala jednu z největších a nejvýznamnějších slavností barokního Brna a Moravy. Architekturu oltáře navrhl Christian Friedrich Rudolph, figury vytvořil rovněž v Augsburku zřejmě zlatníkův příbuzný Johann Jakob Herkommer podle modelů neznámého brněnského sochaře; snad jím byl Jan Jiří Schauberger. Bylo zhotoveno mimořádně honosné baldachýnové retabulum, jeho součástí jsou nejen figury andělů nesoucích zázračný obraz s relikviářem a svatostánek, ale rovněž Herkommerem zhotovený soubor stříbrných svícnů, monstrance, souprava mešního nádobí a slavnostní berla, opatřené shodně znaky a iniciálami objednatele Ondřeje Zirkla s letopočtem 1735. Bohatá architektonická a dekorativní složka oltáře je tvořena řadou symbolických motivů – květy a květinovými girlandami, korunkami, a zejména mušlemi, odkazujícími k etymologii jména Maria („hvězda mořská“). Dnešní vzhled oltáře se od původního, známého z dobových rytin, poněkud liší, neboť brněnský stříbrník František Richter, jak píše ve vyúčtování, Herkommerovo dílo při čištění roku 1776 doplnil „mnohými novými ozdobami".
„Stříbrný oltář“ a obrazem Svatotomské Madony

Nad skříňovým tabernáklem je zasazen v baldachýnovém retabulu rám s obrazem Panny Marie Svatotomské.
Obraz Panny Marie Svatotomské
V katolické věrouce tvoří zvláštní skupinu tzv. milostné obrazy. Rozumí se tím obrazy, které požívají zvláštní úctu, obdiv a důvěru věřících. Na základě důvěry mariánských ctitelů, kterou vkládali do přímluvy Marie u svého syna, vyprosila Maria mimořádné zásahy do života jednotlivců, měst i zemí. Tak tomu je i s milostným obrazem Panny Marie Svatotomské.
Obraz Svatotomské Madony – Palladium města Brna

Obraz je typem nejslavnější a nejvíce rozšířené byzantské mariánské ikony z kláštera Hodegon na okraji Konstantinopole, proto je tento typ Madon nazýván „Hodegetrie“, což znamená „ta, která ukazuje cestu“. Obraz znázorňuje Bohorodičku, která drží Dítě Ježíše, ukazuje na Něho jako na zdroj spásy pro lidstvo. Dítě – Ježíš, představující vtělené Slovo, symbolizované svitkem v levé ruce – zvedá pravou ruku v požehnání.
A svatotomská ikona se skutečně stala průvodkyní nejen pro město Brno, ale i pro celou Moravu. Tak si vysloužila titul Gemma Moraviae, to je Drahokam či Perla Moravy. Stala se útočištěm mariánských ctitelů v nejrůznějších životních nesnázích a pro mimořádná vyslyšení začala být titulována také jako Thaumaturga = řecky – Divotvůrkyně. P. Marii Svatotomské ovšem náleží ještě jeden titul: „Palladium města Brna“, což znamená „zaručující trvání města“. Vždyť pro její přímluvu za ochranu Brna při útoku švédské armády v roce 1645 se stala známá po celé Evropě.
Obraz pochází pravděpodobně z 12. - 13. století (Janetschek). Jedná se o nejstarší deskový obraz na našem území.
Nejstarší nám dochované vypsání původu posvátného obrazu pochází z roku 1493. Vzniklo asi v klášteře augustiniánů v Brně a bylo otisknuto ve slavnostním korunovačním díle „Gemma Moraviae" vydaném v roce 1736.
Tento tisk hovoří o tom, že obraz, který namaloval sám sv. Lukáš a byl uschován v jeruzalémském chrámu, nalezla císařovna sv. Helena (+330), matka císaře Konstantina, při své pouti do Svaté země společně s ostatky sv. Tří králů a Ježíšovým křížem a dovezla ho do Cařihradu. Odtud se dostal do Milána, kde byl uložen až do zničení města císařem Fridrichem I. Barbarossou r. 1162, kdy byl jako válečná kořist obraz spolu s ostatky sv. Tří králů odvezen do Kolína nad Rýnem. Od císaře ikonu za vojenskou pomoc dostal český král Vladislav II., který ji uložil v královské klenotnici baziliky sv. Víta v Praze.
Když se stal Karel IV. císařem, odevzdal r. 1350 svému mladšímu bratrovi Janovi Jindřichovi Lucemburskému markrabství moravské. Jan v Brně založil augustiniánský klášter a kostel Zvěstování Panny Marie a svatého Tomáše. U příležitosti jejich vysvěcení věnoval císař Karel IV. svému bratrovi roku 1356 „starý obraz Matky Boží". Jan Jindřich nechal pro obraz zbudovat zvláštní mariánskou kapli a úcta k obrazu se začala rychle šířit.
Tolik praví o jeho původu legenda. Někteří historikové se domnívají, že obraz je nejspíše kopií obrazu z římského kostela S. Maria del Popolo – kde papež Alexander IV. potvrdil založení augustiniánského řádu, jiní jeho původ předpokládají v Miláně, kde ho Karel IV. pravděpodobně získal na své korunovační cestě roku 1355.
Historicky doloženo je, že roku 1357 papež Inocenc VI. potvrdil odpustky za podmínky pouti k mariánskému obrazu v klášterní kapli, stejně jsou doloženy pozdější odpustky olomouckého biskupa Jana IX. ze Středy.
Přestože se Brno za husitských válek ubránilo, byl kostel a klášter, protože byl mimo hradby města, značně poškozen. Následné války a požár zkázu kostela a kláštera dovršily. Kostel byl jen provizorně opravován. V dalších letech upadalo uctívání milostné P. Marie tak, že skoro přišlo v zapomenutí. Přispělo k tomu i zřícení milostné kaple roku 1580.
Proto se s dalšími kroky k obnovení mariánského kultu u sv. Tomáše setkáváme až po roce 1620. Byl to hrabě František z Magnisů, který obnovil roku 1631 milostnou kapli. V roce 1639 založil převor Jiří Gladich bratrstvo P. Marie.
Z let 1626-1726 bylo zaznamenání 240 milostí, dosažených přímluvou Panny Marie Svatotomské – zázračná uzdravení všeho druhu, záchrana před ohněm a vodními živly, pády z výšky a ochrana před morem a válkou. Když v roce 1645 Švédové obléhali Brno, stala se Matka Boží útočištěm těžce zkoušeného obyvatelstva, a jak se vypravuje, právě v nejnebezpečnější chvíli se objevil nad městem tento obraz a bylo vidět, jak Panna Maria rozprostírá nad Brnem svůj ochranný plášť. To dodalo obráncům tolik síly, že odrazili nejsilnější švédský útok, po kterém nepřítel z města odtáhl.
V roce 1679 zasáhl Moravu a velkou část Evropy mor. V tomto všeobecném nebezpečí si věřící vzpomněli na Pannu Marii Svatotomskou. Královský tribunál a rada města vyzvaly všechen lid z Brna a širšího okolí, aby se zúčastnil slavného průvodu, který bude kolem města se zázračným obrazem uspořádán, a její pomoc si vyprosili. Ještě týž den začal mor ustupovat a brzy docela zanikl. V roce 1713 se mor opět vrátil a obyvatelé města požádali císaře Karla VI. O povolení dalších dvou průvodu. I tentokrát se Panna Maria slitovala a odvrátila morovou ránu.
Obraz byl uctívaný a obecně známý natolik, že převor Ondřej Zirckl požádal papežský stolec o udělení milosti korunování ikony Panny Marie s Ježíšem zlatými korunami s drahokamy. Podle papežských ustanovení byl předpokladem korunovace věhlas obrazu, který uctívali věřící jako zázračný, staří úcty a množství uctívatelů, kteří přicházeli do poutního místa pravidelně a z veliké dálky. Korunovace obrazu v květnu 1736 byla pro město obrovskou slávou. Po průvodech slavobránami byla ikona slavnostně usazena do nového stříbrného oltáře, který byl na objednávku převora zhotoven augsburským zlatníkem Johannem Georgem Herkommerem. Později byla zhotovena věrná kopie obrazu, která byla používána při dalších procesích, aby originál nedošel úhony. Originál obrazu i jeho kopie jsou dodnes vsazeny do stříbrného oltáře.
Jako za války třicetileté, tak i za válek pruských byla Panna Maria u sv. Tomáše v Brně útočištěm těžce zkoušeného města Brna. I později byla P. Maria u brněnských augustiniánů středem zbožnosti věřících. Když např. pro válečné zmatky nebylo možno v roce 1744 konati obvyklou každoroční pout do Mariazell, hlavního poutního místa celého monarchie, putovali věřící z celé Moravy k brněnským augustiniánům.
Úcta mariánská se rozrůstala utěšeně, až přišly protikatolické výnosy Josefa II. Byla zrušena bratrstva, bylo zakázáno konání poutí a byly rušeny kláštery. Augustiniánský klášter se sice podařilo zachránit před zrušením, ale jeho budova byla r. 1783 zabrána pro politické úřady. Císař Josef II. augustiniánům dovolil, aby si do zrušeného kláštera cisterciaček na Starém Brně, kam je přemístil, vzali posvátnou černou Madonu Svatotomskou i nádherný stříbrný oltář.
V roce 1946 byl obraz restaurován brněnskou malířkou Hedvikou Böhmovou a byla mu navrácena jeho původní podoba. Po odstranění všech ozdob byly objeveny nešetrné zásahy a přemalby vzniklé v průběhu staletí. Malba je provedena na desce 86×50 cm, je namalována olejovo-pryskyřičnou temperou na podložce z jedné topolové a dvou lipových desek. Nahoře a na bocích byl obraz dodatečně poněkud seříznut, dříve patrně jen malované monogramy horních rozích byly v neznámé době nahrazeny reliéfními řeckými písmeny ΜΡ ΘΥ, zkratky Méthér Theó – Matka Boží. Není vyloučeno, že k určitým úpravám obrazu došlo při jeho vsazování do nové skříňky roku 1736, kdy tam přibyly zlaté korunky s drahokamy. Od dob napoleonských válek jsou originály obou korunek uschovány a na obraze jsou jejich věrné kopie.
Původní vzhled před restaurováním (kopie obrazu ze zadní strany) - obraz po odstranění přemaleb – obraz po restaurování

Byl prozkoumán i relikviář ve tvaru kosočtvercové skříňky, který byl umístěn pod krkem madony jako šperk a spona Mariina šatu. Poněvadž byla domněnka, že jako relikvie byla uctívána kapka Kristovy krve, čemuž nasvědčovala kapkovitý tvar původního relikviáře, tak i umístění pod srdcem dítěte, bylo dovoleno relikviář otevřít. Jak hovoří restaurátorská zpráva, nachází se v něm dva kusy hedvábí, jeden nažloutlý a druhý světle červený. Pod těmito kousky ležel šestimilimetrový čtverhran ztvrdlého, velice jemného plátna nebo pergamenu s tmavou kapkovitou skvrnou. Obrubu tvořila jemná stříbrná spirálka, která držela pásek s latinským textem, potvrzujícím autentičnost relikvie, totiž kapku Kristovy krve pocházející z Mariiny roušky, skropené Kristovou krví. Po pietní úpravě byl relikviář opět uzavřen a přišroubován na obraz. Na relikviáři jsou vlevo a vpravo připevněny obroubené topasy, poslední to z 24 kusů, které tvořily kdysi svatozář madony. Získání relikvie je dáváno do souvislosti s pobytem Karla IV. před rokem 1354 v trevírském klášteře sv. Maximiana, kde obdržel třetinu Mariiny roušky skropené Kristovou krví. Tuto vzácnou relikvii Kristova utrpení údajně do Trevíru přinesla sv. Helena a darovala ji zdejšímu klášteru. Je možné, že tato legenda sehrála roli při uložení kousku roušky právě do tohoto obrazu Bohorodičky, neboť ikony byzantského typu nesloužily původně jako relikviáře. I když se relikvie při obraze připomíná v písemných pramenech až od roku 1403, je pravděpodobné, že mohla být pro obraz věnována již Karlem IV., aby tímto byla umocněna duchovní hodnota ikony. Historici se domnívají, že relikviářová schránka mohla být přemístěna a uložena do spony na Mariině hrudi v době korunovace obrazu.
Detail relikviáře s kouskem roušky P. Marie

Jako po staletí, stále proudí k Panně Marii Svatotomské poutníci vyprošovat si její pomoc a ochranu. Každoroční oslavy vrcholí 15. srpna na slavnost Nanebevzetí Panny Marie.
Pohled do hlavní lodi baziliky

Boční oltáře
Oltář v malé příčné lodi vlevo: oltář Panny Marie – Matky dobré rady (malý obraz na oltáři je kopie obrazu z italského Genazzano a byl zde umístěn až po příchodu augustiniánů). Velký, ústřední obraz vytvořil malíř a člen jezuitského řádu Ignác Raab s vyobrazením 14 svatých pomocníků: sv. Achácia, sv. Barbory, sv. Blažeje, sv. Cyriaka, sv. Dionýsia, sv. Erasma, sv. Eustacha, sv. Jiljí, sv. Jiří, sv. Kateřiny Alexandrijské, sv. Kryštofa, sv. Markéty, sv. Pantaleona a sv. Víta. U paty sloupů jsou pak sochy českých, moravských a slezských patronů, vytvořené Ondřejem Schweiglem a jeho pomocníky: na vnější straně přízedního sloupového retabula jsou umístěné sochy sv. Cyrila a Metoděje, na vnitřní straně stojí na konzolách sochy sv. Jana Nepomuckého a bl. Jana Sarkandra, v nástavci uprostřed nalezneme postavu sv. Václava a na volutových křídlech postavy sv. Ludmily a sv. Hedviky.
Oltář v malé příčné lodi vpravo: oltář Panny Marie Potěšující. Na spodní části tohoto oltáře je kopie uctívané Boloňské madony (originál je v kostele sv. Jakuba Většího v Bologni), která byla studentem boloňské univerzity z roku 1726 věnována „arcibratrstvu koženého pásku sv. Moniky" v Brně. Arcibratrstvo (trinitáři řádu sv. Augustina) dalo obraz vsadit do oltáře sv. Moniky v kostele sv. Tomáše. V roce 1783 obraz augustiniáni přenesli na Staré Brno. Ozdoby v podobě svatozáří a lemu šatu Panny Marie jsou dílem brněnského stříbrníka Ferdinanda Wissingera. Velký ústřední obraz Všech svatých je od Ignáce Raaba – kromě řady obvyklých světců - sv. Jan Křtitel, sv. Jan Evangelista, sv. Petr, sv. Vavřinec, sv. Augustin aj. znázorňuje rovněž zástup řádových cisterciáckých světců a světic v čele se sv. Bernardem z Clairvaux, jenž přijímá od Ježíška v Mariině náruči kříž. Na římsách a konzolách oltáře se nacházejí Schweiglovy sochy andělů. Vně retabula jsou sochy archandělů Gabriela a Rafaela, na vnitřních konzolách dva další andělé – adoranti a v nástavci postava archanděla Michaela, doprovázená dvojicí andělských figur.
Střední oltář vlevo: oltář Neposkvrněného početí P. Marie – socha P. Marie Lurdské je dílem Johanna Grissemanna z Instu, pochází z roku 1887. Ústřední obraz sv. Benedikta je signovaný Felixem Antonem Schefflerem z roku 1746. Tento oltář O. Schweigl doplnil v šedesátých letech 18. století postavami sv. Šebestiana a sv. Floriána, ochránci před morem a ohněm.
Střední oltář vpravo: oltář Božského Srdce Páně. Socha Božského Srdce Páně od Johanna Grissemanna z Instu, z roku 1889. Ústřední obraz sv. Bernarda z Clairvaux, zakladatele cisterciácké řehole, s anděly a se symboly Kristova umučení, signovaný Felixem Antonem Schefflerem, je z roku 1746. Později oltář doplnil O. Schweigl dřevořezbami svatých Vendelína a Notburgy, oblíbenými ochránci pastýřů a zemědělců.
Oltář velké příčné lodi vlevo: oltář sv. Josefa - na oltáři socha sv. Josefa od Johanna Grissemanna z Instu z roku 1889. Od Josefa Tadeáše Rottera je velký oltářní obraz sv. Anny i menší obraz sv. Petra a Pavla v oltářním nástavci. Sochy církevních otců sv. Řehoře a sv. Jeronýma jsou zřejmě od mladšího bratra Ondřeje Schweigla — Tomáše Schweigla.
Oltář velké příčné lodi vpravo: od roku 2015 nový oltář sv. Rity – na oltáři je socha augustiniánské světice sv. Rity, jedná se o kopii z kostela sv. Kateřiny v Krakově, v oltářním nástavci obraz sester sv. Marie a sv. Marty od Josefa Tadeáše Rottera. U sloupů jsou sochy sv. Prokopa a sv. Jana Nepomuckého, snad také od Tomáše Schweigla.
Oltář sv. Josefa (vlevo) a oltář sv. Rity (vpravo)

Oltář Panny Marie Bolestné – naproti vstupu do kostela. Sochař Ondřej Schweigl svá původní díla pro cisterciačky v kostele Nanebevzetí Panny Marie rozmnožil pro augustiniány o zcela nový oltář Bolestné Panny Marie. Ten se nachází v severní části transeptu pod kůrem z 2. poloviny 17. století. Roku 1784 byla upravena zadní stěna původního oltáře: je konkávně prohnula a má po stranách dvě kasulová okna nad portály. Oltář uprostřed tvoří přízední sloupové retabulum s polychromovanou dřevořezbou Piety z roku 1804 v nice a se štukovou oblačnou svatozáří s andílky a mariánským monogramem v nástavci. U paty sloupů po stranách oltáře jsou bílé štukové sochy sv. Jana Křtitele a jeho otce Zachariáše, které jsou rovněž Schweiglovým dílem. Z původní úpravy tohoto prostoru pocházejí patrně i kované, bohatě zdobené mříže datované 1737, druhotně zasazené ve dveřních otvorech na bocích oltáře. Pozoruhodná je zde rovněž jemná ornamentální zlacená výzdoba architektury ve stylu tehdy módního „gout grec“ s typickými motivy palmet, pletencovým ornamentem zv. guilloche či antikizujícími vázami.
Zajímavostí je i nápis nad oltářem „Altare privilegiatum perpetuum“, označující tento „věčně privilegovaný oltář“. Tato výsada znamenala, že každá mše za zemřelé sloužená u tohoto oltáře získala plnomocné odpustky pro duši v očistci. Papežské výsady v 18. století udělovaly toto privilegium pouze pro jeden oltář konkrétního kostela na určitou dobu, výjimečně i na věčné časy. V současné době se možnost sloužit zádušní mše vztahuje na všechny oltáře v kostele a funkce privilegovaného oltáře se už nepoužívá.
Oltář P. Marie Bolestné s Pietou od O. Schweigla


